python 读取DICOM头文件的实例

所属分类: 脚本专栏 / python 阅读数: 1711
收藏 0 赞 0 分享

用dicompyler软件打开dicom图像,头文件如图所示:

当然也可以直接读取:

ds = dicom.read_file('H:\Data\data\\21662\\2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701\CT\\CT#0#21662#E7AB693D.dcm')
print ds
>>
(0008, 0008) Image Type       CS: ['ORIGINAL', 'SECONDARY', 'AXIAL']
(0008, 0016) SOP Class UID      UI: CT Image Storage
(0008, 0018) SOP Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.501.0
(0008, 0020) Study Date       DA: '20170310'
(0008, 0021) Series Date       DA: '20170310'
(0008, 0023) Content Date      DA: '20060505'
(0008, 0030) Study Time       TM: '1942'
(0008, 0031) Series Time       TM: '1942'
(0008, 0033) Content Time      TM: ''
(0008, 0050) Accession Number     SH: '63071'
(0008, 0060) Modality       CS: 'CT'
(0008, 0070) Manufacturer      LO: 'NOMOS'
(0008, 0090) Referring Physician's Name   PN: ''
(0008, 1010) Station Name      SH: ''
(0008, 1090) Manufacturer's Model Name   LO: 'CORVUS 6.4'
(0010, 0010) Patient's Name      PN: '*M32-2^CHENJUN^^^'
(0010, 0020) Patient ID       LO: '21662'
(0010, 0030) Patient's Birth Date    DA: ''
(0010, 0040) Patient's Sex      CS: ''
(0018, 0050) Slice Thickness      DS: '4.75'
(0018, 0060) KVP         DS: '0'
(0018, 1020) Software Version(s)     LO: 'CORVUS 6.4'
(0018, 5100) Patient Position     CS: 'HFS'
(0020, 000d) Study Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701
(0020, 000e) Series Instance UID     UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.501
(0020, 0010) Study ID       SH: '63071'
(0020, 0011) Series Number      IS: '0'
(0020, 0012) Acquisition Number     IS: '0'
(0020, 0013) Instance Number      IS: '0'
(0020, 0020) Patient Orientation     CS: ['L', 'P']
(0020, 0032) Image Position (Patient)   DS: ['0.73437356948853', '0', '3.25']
(0020, 0037) Image Orientation (Patient)   DS: ['1', '0', '0', '0', '1', '0']
(0020, 0052) Frame of Reference UID    UI: 2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.601
(0020, 0060) Laterality       CS: ''
(0020, 1040) Position Reference Indicator  LO: ''
(0020, 1041) Slice Location      DS: '3.25'
(0028, 0002) Samples per Pixel     US: 1
(0028, 0004) Photometric Interpretation   CS: 'MONOCHROME2'
(0028, 0010) Rows        US: 330
(0028, 0011) Columns        US: 339
(0028, 0030) Pixel Spacing      DS: ['0.734375', '0.734375']
(0028, 0100) Bits Allocated      US: 16
(0028, 0101) Bits Stored       US: 12
(0028, 0102) High Bit       US: 11
(0028, 0103) Pixel Representation    US: 0
(0028, 1052) Rescale Intercept     DS: '-1024'
(0028, 1053) Rescale Slope      DS: '1'
(7fe0, 0010) Pixel Data 

发现一套图的第一张和最后一张的Slice Thickness往往和中间层的值是不同的。

Path = 'H:\Data\data\\21662\\2.16.840.1.113662.2.0.105002416.1489146183.701\CT\\a.dcm'
slices = dicom.read_file(path)
spacing = slices.PixelSpacing

读取头文件信息方法:

Slices.上图头文件中的name列。

这时要注意的是,name大小写不变,去掉空格,去掉符号,比如括号。

举例:

origin = slices.SoftwareVersions
print origin
>>CORVUS 6.4
spacing = slices[1].PixelSpacing
print spacing
>>['0.734375', '0.734375']

以上这篇python 读取DICOM头文件的实例就是小编分享给大家的全部内容了,希望能给大家一个参考,也希望大家多多支持脚本之家。

更多精彩内容其他人还在看

Python实现按学生年龄排序的实际问题详解

这篇文章主要给大家介绍了关于Python实现按学生年龄排序实际问题的相关资料,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面跟着小编来一起学习学习吧。
收藏 0 赞 0 分享

Python开发的HTTP库requests详解

Requests是用Python语言编写,基于urllib,采用Apache2 Licensed开源协议的HTTP库。它比urllib更加方便,可以节约我们大量的工作,完全满足HTTP测试需求。Requests的哲学是以PEP 20 的习语为中心开发的,所以它比urllib更加P
收藏 0 赞 0 分享

Python网络爬虫与信息提取(实例讲解)

下面小编就为大家带来一篇Python网络爬虫与信息提取(实例讲解)。小编觉得挺不错的,现在就分享给大家,也给大家做个参考。一起跟随小编过来看看吧
收藏 0 赞 0 分享

在python3环境下的Django中使用MySQL数据库的实例

下面小编就为大家带来一篇在python3环境下的Django中使用MySQL数据库的实例。小编觉得挺不错的,现在就分享给大家,也给大家做个参考。一起跟随小编过来看看吧
收藏 0 赞 0 分享

Python 3.x读写csv文件中数字的方法示例

在我们日常开发中经常需要对csv文件进行读写,下面这篇文章主要给大家介绍了关于Python 3.x读写csv文件中数字的相关资料,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面跟着小编来一起学习学习吧。
收藏 0 赞 0 分享

Python实现解析Bit Torrent种子文件内容的方法

这篇文章主要介绍了Python实现解析Bit Torrent种子文件内容的方法,结合实例形式分析了Python针对Torrent文件的读取与解析相关操作技巧与注意事项,需要的朋友可以参考下
收藏 0 赞 0 分享

Python实现文件内容批量追加的方法示例

这篇文章主要介绍了Python实现文件内容批量追加的方法,结合实例形式分析了Python文件的读写相关操作技巧,需要的朋友可以参考下
收藏 0 赞 0 分享

Python简单实现自动删除目录下空文件夹的方法

这篇文章主要介绍了Python简单实现自动删除目录下空文件夹的方法,涉及Python针对文件与目录的读取、判断、删除等相关操作技巧,需要的朋友可以参考下
收藏 0 赞 0 分享

简单学习Python多进程Multiprocessing

这篇文章主要和大家一起简单的学习Python多进程Multiprocessing ,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们可以参考一下
收藏 0 赞 0 分享

Python导入模块时遇到的错误分析

这篇文章主要给大家详细解释了在Python处理导入模块的时候出现错误以及具体的情况分析,非常的详尽,有需要的小伙伴可以参考下
收藏 0 赞 0 分享
查看更多