下载和安装 Doxygen
到 Doxygen 官网 下载最新的Doxygen安装程序，然后安装。这个软件包包括了一个GUI界面的前端工具，可以帮助我们方便创建Doxygen配置文件和生成目标文档。
下载和安装 chm 编译器
我们使用微软古老的 HTML Help Workshop 1.3，这个软件N久没更新了。
下载地址： 微软官网
下载后根据提示安装。
项目一般设置
首先在“Wizard”标签的Project项进行如下设置：
项目名称：将在最新的文档首页中显示
源码列表：选择要生成文档的源代码或目录，可以有多个文件或目录形成一个列表。建议使用相对路径，相对于当前目录（也即当前配置文件所在的目录）
递归扫描：如果需要对整个源码目录下的所有子目录及文件生成文档，请勾选本项
输出目录：设置最终生成的帮助文档的存储路径，建议使用相对路径
下一步，
Mode项，根据需要设置文档生成模式。
下一步，Output项，设置输出格式，
勾选HTML和“prepare for compressed HTML(.chm)”
然后切换到“Expert”标签的“HTML”项，设置HTML和CHM相关的选项：
GENERATE_HTMLHELP：确保已经勾选了
CHM_FILE：最终生成的.chm的文件名，如“HkcProjectHelp.chm”。默认为“index.chm”。可以使用路径，也可以使用相对路径，相对于上面设置的输出目录的html目录（建设使用上一级目录，如“..\MyDoc.chm”）
**HHC_LOCATION：**chm 编译器（hhc.exe）的全路径。请指到 HTML Help Workshop 的安装目录的 hhc.exe 程序
**CHM_INDEX_ENCODING：**chm索引文件编码，下面会讲到，这里填“GBK”
编码设置
编码设置很重要，如果设置不当，生成的文档会出现乱码。因为 Doxygen 汲及的东西多，有好几项编码设置，所以需要认真对待，根据项目的实情情况设置。
所有高级设置（包括编码设置）都在“Expert”标签，重要的设置项如下：
Project/DOXYFILE_ENCODING：当前 Doxygen 配置文件本身的字符编码，默认为UTF-8，一般不需要修改
Project/OUTPUT_LANGUAGE：输出语言。这里是指Doxygen自己生成的导航、提示、帮助等文本的文字采用的语言。我们希望帮助文档是全中文的，所以选择Chinese
Input/INPUT_ENCODING：输入文件的编码。这里是指我们的源代码文件本身的编码。在Windows平台一般是系统编码（GBK），而Linux平台一般是UTF-8。请用文本编辑器查看源文件的编码。这里如果设置的不一致，源码文件的注释中所有非ASCII字符将在生成的文档中变成乱码。
HTMP/CHM_INDEX_ENCODING：这里设置Doxygen生成的CHM索引文件的编码，以前是不能设置的，默认为UTF-8，而微软的编译器不能识别UTF-8编码的索引文件，所以最终造成左边目录导航栏乱码。我们设置它为GBK，这样Doxygen将为我们生成GBK编码的索引文件（.hhc、.hhk、.hhp）
生成CHM文档
设置好了后，点击“Run”→“Run doxygen”生成最终的.chm文档，如果设置正确，打开后是全中文的了。
使用doxygen生成中文pdf文档
作者：zyl910
众所周知，能够利用doxygen生成pdf文档——但是，如果其中含有中文的话，那就会遇到一大堆问题无法顺利输出。我花了很长时间摸索，最终找到了让doxygen顺利生成中文pdf的办法。
系统环境——
1) Mac OS X Lion 10.7.5 + MacTeX-2012 。
2) Windows XP SP3 + CTeX 2.9.2.164 。
一、原理解释
doxygen本身并不能直接输出pdf文件，而是生成了latex目录，其中有一个 makefile 文件。若系统中装好了pdflatex，可在latex目录中运行“make”命令来生成pdf文件。
怎样才能装好pdflatex呢？mac平台可安装MacTeX，windows平台可安装CTeX。
环境装好之后，当在latex目录中运行“make”命令来生成pdf文件时会发现——纯英文文档能顺利生成pdf；而含有中文时，不能顺利生成pdf文件。
对于latex排版，doxygen其实已经做了很多准备，比如——源文件是UTF-8编码，并默认使用了utf8 package。理论上是支持多国语言的。
可对于中文来说，还需要加载 CJKutf8 package，并配置好CJK环境。这才能顺利的使用中文。
二、解决方案
具体步骤——
1) 使用docxygen生成文档，注意选上 GENERATE_LATEX 、LATEX_OUTPUT、USE_PDFLATEX（最好还选上 PDF_HYPERLINKS）；
2) 用文本编辑器打开docxygen生成的latex目录中的refman.tex。找到“\begin{document}”这一行，将其修改为——
\usepackage{CJKutf8}
\begin{document}
\begin{CJK}{UTF8}{gbsn}
然后再找到“\end{document}”这一行，将其修改为——
\end{CJK}
\end{document}
保存，关闭。
3) 打开终端，使用cd命令进入latex目录，然后执行“make”命令。执行完毕后后，该目录中会出现“refman.pdf”——
我在 mac + MacTeX 环境下make时，能完美生成带书签的pdf。
而在 win + CTeX 环境下make时，其中还会弹出一堆错误（输入r再回车，可忽略后续错误），但是最终还是能够生成中文的pdf，可惜一般不能顺利的构造好书签。
