python实现聚类算法原理

所属分类: 脚本专栏 / python 阅读数: 968
收藏 0 赞 0 分享

本文主要内容:

  • 聚类算法的特点
  • 聚类算法样本间的属性(包括,有序属性、无序属性)度量标准
  • 聚类的常见算法,原型聚类(主要论述K均值聚类),层次聚类、密度聚类
  • K均值聚类算法的python实现,以及聚类算法与EM最大算法的关系
  • 参考引用

先上一张gif的k均值聚类算法动态图片,让大家对算法有个感性认识:

其中:N=200代表有200个样本,不同的颜色代表不同的簇(其中 3种颜色为3个簇),星星代表每个簇的簇心。算法通过25次迭代找到收敛的簇心,以及对应的簇。 每次迭代的过程中,簇心和对应的簇都在变化。

聚类算法的特点

聚类算法是无监督学习算法和前面的有监督算法不同,训练数据集可以不指定类别(也可以指定)。聚类算法对象归到同一簇中,类似全自动分类。簇内的对象越相似,聚类的效果越好。K-均值聚类是每个类别簇都是采用簇中所含值的均值计算而成。

聚类样本间的属性(包括,有序属性、无序属性)度量标准 1. 有序属性

例如:西瓜的甜度:0.1, 0.5, 0.9(值越大,代表越甜)

我们可以使用明可夫斯基距离定义:

2. 无序属性

例如:色泽,青绿、浅绿、深绿(又例如: 性别: 男, 女, 中性,人yao…明显也不能使用0.1, 0.2 等表示求距离)。这些不能使用连续的值表示,求距离的,一般使用VDM计算:

聚类的常见算法,原型聚类(主要论述K均值聚类),层次聚类、密度聚类

聚类算法分为如下三大类:

1. 原型聚类(包含3个子类算法):

K均值聚类算法

学习向量量化

高斯混合聚类

2. 密度聚类:

3. 层次聚类:

下面主要说明K均值聚类算法(示例来源于,周志华西瓜书)

算法基本思想:

K-Means 是发现给定数据集的 K 个簇的聚类算法, 之所以称之为 K-均值 是因为它可以发现 K 个不同的簇,且每个簇的中心采用簇中所含值的均值计算而成.簇个数 K 是用户指定的, 每一个簇通过其质心(centroid), 即簇中所有点的中心来描述.

算法流程如下:

主要是三个步骤:

  • 初始化选择K个簇心,假设样本有 m个属性,则相当于k个m为向量
  • 对于k个簇,求离其最近的样本,并划分新的簇
  • 对于每个新的簇,更新簇心的向量(一般可以求簇的样本的属性的均值)
  • 重复2~3直到算法收敛,或者运行了指定的次数

下面给出西瓜书的示例:

西瓜包含下面两个属性,密度以及含糖率,这两个属性构成的二维向量,作为输入向量(具体数据如下表)

算法大致过程如下:

下图是分类的,每一轮簇心的更新结果,图中横坐标为密度属性,纵坐标为含糖率属性:

4. K均值聚类算法的python实现

下面给出K-means cluster算法的实现的大致框架:

class KMeans(object):
  def __init__(self, k, init_vec, max_iter=100):
    """
    :param k:
    :param init_vec: init mean vectors type: k * n array(n properties)
    """
    self._k = k
    self._cluster_vec = init_vec
    self._max_iter = max_iter

  def fit(self, x):
    # 迭代最大次数
    for i in xrange(self._max_iter):
      print 'iteration %s' % i
      # 求每个簇心的簇类
      d_cluster = self._cluster_point(x)
      # 对现有的簇类,更新簇心
      new_center_node = self._reevaluate_center_node(d_cluster)

      # 检测簇心是否变化,判断算法收敛
      if self._check_converge(new_center_node):
        print 'found converge node'
        break
      else:
        self._cluster_vec = new_center_node

  def _cal_distance(self, vec1, vec2):
    return np.linalg.norm(vec1 - vec2)

  def _cluster_point(self, x):
    # 求每个簇心的簇
    pass
    return d_cluster

  def _reevaluate_center_node(self, d_cluster):
    # 对新的簇,求最佳簇心
    return arr_center_node

  def _check_converge(self, vec):
    # 判断簇心是否改变,算法收敛
    return np.array_equal(self._cluster_vec, vec)

具体的算法,以及见本人的github

下面给出程序的运行结果, 由图可见经过三次迭代程序收敛,并且找到最佳节点:

下面再给出,另一次运行结果,可见由于初始化点选择不一样,得到的结果也是不一样的,初始点的选择对聚类算法的影响还是很大。

K-means实际上是EM算法的一个特例,根据中心点(簇心)决定数据点归属是expectation,而根据构造出来的cluster更新中心(簇心)则是maximization。理解了K-means,也就顺带了解了基本的EM算法思路。

5. 参考引用

参考引用地址

以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持脚本之家。

更多精彩内容其他人还在看

Python实现按学生年龄排序的实际问题详解

这篇文章主要给大家介绍了关于Python实现按学生年龄排序实际问题的相关资料,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面跟着小编来一起学习学习吧。
收藏 0 赞 0 分享

Python开发的HTTP库requests详解

Requests是用Python语言编写,基于urllib,采用Apache2 Licensed开源协议的HTTP库。它比urllib更加方便,可以节约我们大量的工作,完全满足HTTP测试需求。Requests的哲学是以PEP 20 的习语为中心开发的,所以它比urllib更加P
收藏 0 赞 0 分享

Python网络爬虫与信息提取(实例讲解)

下面小编就为大家带来一篇Python网络爬虫与信息提取(实例讲解)。小编觉得挺不错的,现在就分享给大家,也给大家做个参考。一起跟随小编过来看看吧
收藏 0 赞 0 分享

在python3环境下的Django中使用MySQL数据库的实例

下面小编就为大家带来一篇在python3环境下的Django中使用MySQL数据库的实例。小编觉得挺不错的,现在就分享给大家,也给大家做个参考。一起跟随小编过来看看吧
收藏 0 赞 0 分享

Python 3.x读写csv文件中数字的方法示例

在我们日常开发中经常需要对csv文件进行读写,下面这篇文章主要给大家介绍了关于Python 3.x读写csv文件中数字的相关资料,文中通过示例代码介绍的非常详细,对大家具有一定的参考学习价值,需要的朋友们下面跟着小编来一起学习学习吧。
收藏 0 赞 0 分享

Python实现解析Bit Torrent种子文件内容的方法

这篇文章主要介绍了Python实现解析Bit Torrent种子文件内容的方法,结合实例形式分析了Python针对Torrent文件的读取与解析相关操作技巧与注意事项,需要的朋友可以参考下
收藏 0 赞 0 分享

Python实现文件内容批量追加的方法示例

这篇文章主要介绍了Python实现文件内容批量追加的方法,结合实例形式分析了Python文件的读写相关操作技巧,需要的朋友可以参考下
收藏 0 赞 0 分享

Python简单实现自动删除目录下空文件夹的方法

这篇文章主要介绍了Python简单实现自动删除目录下空文件夹的方法,涉及Python针对文件与目录的读取、判断、删除等相关操作技巧,需要的朋友可以参考下
收藏 0 赞 0 分享

简单学习Python多进程Multiprocessing

这篇文章主要和大家一起简单的学习Python多进程Multiprocessing ,具有一定的参考价值,感兴趣的小伙伴们可以参考一下
收藏 0 赞 0 分享

Python导入模块时遇到的错误分析

这篇文章主要给大家详细解释了在Python处理导入模块的时候出现错误以及具体的情况分析,非常的详尽,有需要的小伙伴可以参考下
收藏 0 赞 0 分享
查看更多